1910年初，吳祿貞被調(diào)回北京，授以鑲紅旗蒙古副都統(tǒng)，成為留學日本士官生中的第一個八旗都統(tǒng)。

武昌起義爆發(fā)后，吳祿貞在石家莊和灤州的新軍第二十鎮(zhèn)，以及山西起義軍暗中聯(lián)絡，準備三路進攻北京。但就在此時，原第六鎮(zhèn)第十二協(xié)統(tǒng)周符麟和衛(wèi)隊營長馬步周等人刺殺了吳祿貞。到底誰主謀刺殺吳祿貞的呢?刺殺吳祿貞的說法總結(jié)為以下幾種。

其一，清廷殺吳。原來當年清廷為了堤防手握重兵的袁世凱，起用吳祿貞為第六鎮(zhèn)統(tǒng)制;其二，袁世凱殺吳。當時的直隸總督陳夔龍在《夢蕉亭雜記》中認為吳祿貞：“為項城(袁世凱)遣人暗殺”;其三，清廷和袁世凱聯(lián)合殺吳。吳祿貞的參謀何遂認為：是清廷和袁世凱一起謀殺了吳祿貞。

吳祿貞的死，顯示了北方革命黨人同清政府、北洋派爭奪軍權(quán)失敗了。清廷派遣吳祿貞前去灤州，表面上看這是一招臭棋，因為吳祿貞看似是屬于革命黨人，但實際上軍咨大臣載濤為首的清廷內(nèi)部立憲派才是決定此事的背后集團。所以直到現(xiàn)在，關于吳祿貞是革命黨人還是立憲黨人，學界都莫衷一是。

吳祿貞的死已經(jīng)成了一樁歷史懸案、而灤州兵變和他們的逆天計劃，也不過只是歷史的一個泥濘角落，不再被人們一瞥。